6月8日，国新办就《海南自由贸易港建设总体方案》有关情况举行发布会，国家发展改革委副主任林念修在接受媒体采访时表示，海南自由贸易港与香港的定位不同，重点发展产业也不同。下一步，在海南建设自由贸易港进程中，将进一步加强与粤港澳大湾区的联动发展，积极开展务实有效的合作，保障香港的长治久安和长期繁荣稳定，确保“一国两制”实践行稳致远。
据了解，6月7日，中国（深圳）综合开发研究院举办了一场“海南自贸港·粤港澳大湾区：制度集成创新的开放新高地”的研讨会，探讨海南自贸港和粤港澳大湾区之间的联动发展。
在研讨会上，中国（深圳）综合开发研究院常务副院长郭万达也提到了海南自由贸易港与香港之间的关系，他认为二者之间是相互支撑、相互补充的，并非替代关系。香港的单独关税区地位是世贸组织多边规则确立的，并且通过《中华人民共和国香港特别行政区基本法》确认，但海南自贸港的定位是“海关监管特殊区域”，并不是单独关税区。而且海南自贸港的开放是渐进的。
《海南自由贸易港建设总体方案》专门提及，促进与粤港澳大湾区联动发展。
如何联动发展？郭万达总结了三个方面。
一是制度联动。中国的开放制度是你追我赶的。海南的政策中也有借鉴了粤港澳大湾区的部分，比如高端人才和紧缺人才不超过15%的个人所得税，最早是前海试行“境外高端人才和紧缺人才享受15%个税优惠”，之后到横琴，再到整个粤港澳大湾区。在中国扩大开放的势头下，未来有些制度开放是可以联动的。
二是市场互动。粤港澳大湾区人口为7000多万，GDP总量超过10万亿元，相比之下，海南的常住人口不到1000万，2019年GDP为5300多亿元，深圳的南山区GDP就有6000多亿。海南自贸港和粤港澳大湾区，零售市场、旅游市场以及其他，相互之间都可以做很多联通。
三是产业联动。海南最重要的不是发展工业，但也提出来将围绕生态环保、生物医药、新能源汽车、智能汽车等壮大先进制造业。粤港澳大湾区是全世界重要的智能制造基地，拥有完整的产业链、供应链，所以在产业方面也是可以相互联动起来的。