据深圳媒体消息，深圳已成立高规格的深港科技创新特别合作区领导小组及4个专责领导小组。并计划未来将在人员出入境政策，资金跨境流动政策及科技产业准入制度改革进行探索。
据介绍，市发改委牵头编制的合作区总体规划和先行先试的政策，基本完成了合作区深方区域1+N规划体系的衔接。市科创委牵头编制了合作区的科技产业规划，明确以微电子、人工智能、生物医药、新材料为重点产业发展方向。市规土委牵头编制了合作区空间规划，提出了“一心两翼”的总体空间布局，“一心”是在福田口岸建设综合服务枢纽。市交委会同口岸办编制了口岸区的交通规划，在皇岗口岸引入3条城际轨道和两条地铁线路，以及开展皇岗口岸改造和广深改造等重点工程。
深圳计划在深港科技创新特别合作区研究方向主要包括：为符合条件人员提供绿色通道和无感通关服务，探索实行更为便利的人员出入境政策，同时还将设立科技创业投资基金出入境绿色通道，试行科技资金跨境流动政策，此外还将建设新兴产业标准规则创新先行区，与香港合作发展人工智能、生物医药、金融科技等新兴产业，实行科技产业准入制度改革。
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