10月31日，财政部发布《关于支持深圳探索创新财政政策体系与管理体制的实施意见》，明确支持深圳探索促进公共服务优质均衡的财政政策体系、促进经济高质量发展的财政政策体系，支持深圳加快建立与先行示范区相适应的现代财税体制，支持深圳探索提升财政管理效能的有效路径。
按照《意见》，鼓励深圳完善民生供给服务财政保障体制，建立健全民生政策备案和支出清单管理制度，增强惠民政策获得感和可持续性。发挥中央财政农业转移人口市民化奖励资金作用，推动进城落户农业转移人口与当地户籍居民享受同等基本公共服务。
在教育、医疗等民生资源配置上，加快构建义务教育投入足额保障、非义务教育成本合理分担、规范鼓励支持社会力量投资办学的教育投入体制。鼓励深圳通过各项财税政策引导建立区域协同、错位发展、优质高效的公立医院体系，扩大优质医疗卫生资源供给。
《意见》指出，将鼓励社会力量向政府科学基金或科技计划捐赠，探索鼓励企业加大科技投入的财税政策。支持深圳探索建立对研究与试验发展(R&D)经费投入激励机制，吸引和鼓励龙头企业、专精特新企业、社会组织布局投入大型研发项目，加大研发投入。鼓励深圳通过财政资金、市场化经营收入等多元化方式，支持重大科技公共基础设施运营。鼓励深圳建立科学仪器设备开放共享后补助奖励机制，推进大型科研仪器设备和重大科技基础设施共建共享共用。
同时，支持加快构建面向未来的现代产业体系。鼓励深圳整合优化财政资源布局，构建支撑现代产业发展的市政府引导基金投资新体系。鼓励深圳探索创新农业保险产品和服务，助力构建具有深圳特色的现代农业产业体系。支持深圳加强财政金融联动，综合运用融资担保、市场化风险补偿、贷款贴息等方式，引导金融资源更好服务实体经济，培育壮大市场主体。
此外，《意见》表示，在不增加地方政府隐性债务的前提下，鼓励深圳探索轨道交通项目建设资本金、投融资、建设运营模式改革，积极开展综合货运枢纽补链强链工作。支持深圳打造国际消费中心城市，建设深圳国际珠宝玉石综合贸易平台，落实好进境免税店、出境免税店等政策，引导境外高端消费回流。深化国际财经交流合作，指导深圳电报国际金融组织主权贷款，指导深圳企业加强与有关国际金融组织的非主权业务合作，鼓励深圳积极承办国际多双边经济对话等国际财经交流活动。、
值得注意的是，《意见》明确，考虑深圳人口持续净流入对住房的需求，加大中央预算内投资对深圳保障性住房筹集建设的补助，加大中央财政城镇保障性安居工程补助资金对深圳公租房、保障性租赁住房和老旧小区改造的支持力度，推动解决大城市住房突出问题。